序卷之一头目卷之二耳鼻舌卷之三口面项喉卷之四心神卷之五胸腹卷之六身卷之七背手足卷之八溺孔肛门
扁鹊神应鍼灸玉龙经
伤寒论翼
简介序凡例卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十附录
简介序叙卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二卷十三卷十四卷十五卷十六卷十七卷十八卷十九卷二十卷二十一跋
简介卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十
孙真人《千金方》论王唯一《明堂铜人灸经》量同身寸法第一正坐伸臂法第二揣骨定穴高下法第三定穴相去远近法第四钩股按穴取平法第五参验求穴法第六坐点坐灸法第七石用之取穴别法第八叶潘等取穴别法第九灸讫补养法第十
序自序游艺志略自序精义汇通六经提纲六字真言六气便解医经补正治病法解一治病法解二素问摘要三证合参说寒说温风温湿温说疫辨证治法指南审脉附∶游艺志略
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
明目论看眼诀图眼病歌诀冷眼歌诀热眼歌诀药性光明赋五经虚泻五经火眼目虚实冷热论点药药性炮炼法男女禁忌看眼法演药法点药法制药法煎膏法研药法合药法用药法服药法禁忌主药方辅药方加减方按五轮治疗捷法四季加减煎药