卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
序一序二自叙卷首 十二经络图象手太阴肺经图手阳明大肠经图足阳明胃经图足太阴脾经图手少阴心经图手太阳小肠经图足太阳膀胱经图足少阴肾经图心包络经图三焦经图足少阳胆经图足厥阴肝经图卷上肺经第一大肠经第二胃经
黄帝内经素问遗篇
缪序卷一一、卒尸二、痹三、？（痉）四、痿五、厥六、伤寒六经余证七、大头肿痛（附:蛤蟆瘟）蛤蟆瘟八、霍乱九、瘟病十、伤暑十一、疟十二、疸十三、劳（劳极 烦热 劳瘵）劳极烦热劳瘵卷二十四、热十五、吐衄下血
脏腑虚实标本用药式
第1部分第2部分第3部分第4部分
序叙自序卷之一·述古卷之二·论治瘟疫名义论疫病有三种论用党参宜求真者论治瘟疫慎用古方大寒剂论用大黄石膏芒硝论立方用药论疫症繁多论治疫症最宜变通论抄复论仅读伤寒书不足以治瘟疫不读伤寒书亦不足以治瘟疫论读
序叙自叙御定医宗金鉴麻疹卷一疹原轻重麻疹主治大法麻疹未出证治麻疹见形证治麻疹收没证治卷二身热不退烦渴谵妄喘急咳嗽喉痛失音牙疳呕吐泻泄痢疾腹痛衄血瘙疹盖痘疹瘾疹卷三 （附采诸家麻后证治）麻后龟胸麻后肺痿
序舌苔原理看舌八法黄苔类总论白苔类总论舌质无苔类总论黄苔类分别诊断法白苔类分别诊断法舌质无苔分别诊断法苔色变换吉凶总论苔之真退假退驳去辨燥润辨浓腐之苔无寒症辨浓腐与浓腻不同辨舌短舌强辨补:黑苔类
卷上论疮肿诊候入式法论荣卫色脉参应之法论持手诀消息法论三部所主脏腑病证论脉证名状二十六种所主病证论三部脉所主证候论三部脉所主杂病法诀论诊候肺疽肺痿法论将护忌慎法论疮疽肿虚实法辨疮肿浅深法辨脓法辨疮疽疖