绪言卷一摄生第一阴阳第二脏象上第三脏象下第三卷二脉色上第四脉色下第四经络上第五卷三经络下第五标本第六气味第七论治第八卷四疾病第九病机邪气阴阳卷四疾病第十经脏虚实时令卷五疾病第十一五气情志风厥伤寒卷五疾
凡例卷一九恨十三不可学十传摹看手指筋纹乃医家异教说治病不可关门杀贼说治病不可开门揖盗说汤方内更换药味说看病秘诀死症辨卓溪家传口诀推拿代药赋卷二阐明五脏生克以知补母泻子辨脐风辨胎寒辨胎热辨胎毒发丹辨胎惊
卷一中风总括中风死候类中风总括伤风总括痉病总括痉病死证破伤风痹病总括周痹痹病生死证痹入脏腑证痿病总括痿痹辨似痿病治法香港脚总括香港脚死证卷二内伤总括内伤外感辨似虚劳总括虚劳死证虚劳治法痨瘵总括痨瘵治法
卷之一周身经穴赋十二经脉歌十二经本一脉歌经穴起止歌十五脉络歌经脉气血多少歌禁针穴歌禁灸穴歌血忌歌逐日人神歌九宫尻神歌太乙人神歌孙思邈先生针十三鬼穴歌长桑君天星秘诀歌马丹阳天星十二穴并治杂病歌四总穴歌千
素问玄机原病式
进表卷一治诸风（附香港脚）至宝丹灵宝丹润体丸乌犀丸牛黄清心丸摩挲丸透冰丹龙脑天麻煎牛黄小乌犀丸娄金丸龙虎丹麝香天麻丸龙脑芎犀丸银液丹和太师牛黄丸碧霞丹雄朱丸八风丹牛黄生犀丸辰砂天麻丸青州白丸子辰砂丸牛
序一序二序三序四凡例十六则劝医六则七方论十剂论辟陶隐居十剂内增入寒热二剂论辟缪仲醇十剂内增升降二剂论卷之一（宫集）人参黄芪甘草白术苍术熟地生地当归牛膝远志石菖蒲卷之二（商集）天门冬麦门冬五味子菟丝子甘
卷首序奏玉帝青辞进医书表卷上当明经络须识扶阳住世之法大病宜灸三世扁鹊时医三错忌用转下禁戒寒凉要知缓急五等虚实黄帝灸法扁鹊灸法附∶窦材灸法卷中伤寒伤寒四经见证太阳见证阳明见证太阴见证少阴见证伤风伤寒挟食
自叙后序卷一甘草白术人参大枣胶饴粳米薏苡小麦大麦神曲吴茱萸蜀椒干姜生姜半夏代赭石厚朴枳实栀子香豉瓜蒂蜀漆黎芦升麻葛根赤石脂禹余粮鸡子黄麻仁白蜜大黄巴豆卷二当归阿胶地黄芍药防风柴胡黄芩黄柏白头翁秦皮白蔹
高刻丹溪治法心要原序重印丹溪治法心要序卷一中风（第一）癞风（第二）伤寒（第三）内伤（第四）暑（第五）注夏（第六）暑风（第七）胃风（第八）湿（第九）火（第十）郁（第十一）伤风（第十二）时病（第十三）斑疹